Co roku Fundacja na rzecz Nauki Polskiej realizuje kilkanaście programów adresowanych do naukowców wszystkich dziedzin. Nasza oferta programowa obejmuje: konkurs o Nagrodę FNP, uznawaną za najważniejsze w Polsce wyróżnienie za osiągnięcia naukowe, różne programy o charakterze stypendialnym skierowane przede wszystkim do młodych uczonych oraz kilka innych programów subwencyjnych, przeznaczonych dla zespołów i instytucji naukowych, poprzez które Fundacja stara się możliwie elastycznie reagować na różne potrzeby środowiska naukowego.

Na wspieranie nauki w 2008 r. Fundacja zamierza przeznaczyć ponad 46 mln zł. Ponaddwukrotny wzrost nakładów na realizację działalności programowej Fundacji w tym roku wynika przede wszystkim z podjęcia przez nią realizacji programów finansowanych z Europejskiego Funduszu Rozwoju Regionalnego w ramach Programu Operacyjnego Innowacyjna Gospodarka 2007-2013.

Subwencje, nagrody oraz stypendia, które oferuje Fundacja, przyznawane są zawsze w trybie konkursu.